"מרכבת היהלום" מורכבת משתי יצירות - הנובלה "לוכד השפיריות" והרומן "בין השורות"- המתרחשות במקומות שונים ובתקופות שונות, ובה-בעת מקושרות ביניהן באורח הדוק ומפתיע.
עלילת "לוכד השפיריות", הקרוי על שמו של שיר הייקו קלאסי, מתרחשת בקיסרות הרוסית, בימי מלחמת רוסיה-יפן (1905-1904). אראסט פטרוביץ' פנדורין שב למולדתו על-מנת למלא את חובתו הפטריוטית, ומופקד על הגנת המסילה הטרנס-סיבירית, עורק התחבורה היחיד והפגיע של רוסיה אל החזית המדממת שבמזרח הרחוק. מולו ניצב יריב רב-תושייה ושופע כישורים, רצחני מאין כמוהו, הדומה לפנדורין ביותר מתכונה אחת.
הרומן "בין השורות" לוקח את הקורא אל הקיסרות היפנית המתחדשת של שנת 1878, מעניק תשובות מפתיעות לשאלות שנותרו פתוחות לאחר קריאת הנובלה, ומשלים את "השנים החסרות" של פנדורין –שנות שליחותו הדיפלומטית בארץ השמש העולה. שם, יהיה על גיבורנו לפתור תעלומות בלשיות, לרכוש חברים לחיים, להתאהב בעלמות-חן אקזוטיות, לסכל מזימות פוליטיות, להתמודד במאבקים בין מעצמות קולוניאליות, להילחם במתנקשי הנינג'ה המסתוריים ואף ללמוד את אומנותם הסודית. סיומו של הרומן ישאיר גם את קוראי אקונין האדוקים ביותר פעורי פה!
בוריס אקונין, כהרגלו, שוזר ביצירתו הסוחפת מחוות סגנוניות ועלילתיות ליצירות הקלאסיות של הספרות הרוסית, המערבית והיפנית, החל באובלומובשל א.א. גוֹנְצַ'רוֹבדרךשלושת המוסקטריםמאת אלכסנדר דיומא האב ושוגון מאת ג'יימס קלאוול, וכלה בשירת הייקו ובמשלי החוכמה הזן-בודהיסטיים.