ספרו הראשון, קובץ הסיפורים "ילדה שחורה", ראה אור בשנת 1999 (הוצאת בבל).  ב-2019 עבר לגור בברלין וכתב שם את ספרו חמור. 

הוקרה ופרסים
בשנת 1999 זכה סמי ברדוגו בפרס הסיפור הקצר של העיתון הארץ. לקובץ סיפוריו "ילדה שחורה" הוענק פרס לספרי ביכורים לשנת 1999 מאת משרד המדע, התרבות והספורט והספר שובץ בתוכנית לימודי הספרות של משרד החינוך.
בשנת 2002 זכה בפרס "יעקב שבתאי" על הרומן "ככה אני מדברת עם הרוח".
בשנת 2003 תשס"ג זכה בפרס ברנשטיין על ספרו "ככה אני מדברת עם הרוח".
בשנת 2006 תשס"ו זכה בפרס ראש הממשלה, פרס היצירה הספרותית על שם לוי אשכול.
בשנת 2007 זכה בפרס ניומן לשנת תשס"ז מטעם אוניברסיטת בר-אילן על הישגיו בפרוזה עברית.
בשנת 2008 קיבל מלגת כתיבה ושהייה ברזידנסי, אוקספורד אנגליה – המרכז ללימודי עברית ויהדות ונכלל ברשימה הקצרה של פרס ספיר עם ספרו "יתומים".
בשנת 2011 זכה בפרס רמת גן לספרות לייב גולדברג (קרן קיימת לישראל) ונכלל ברשימה הארוכה של פרס ספיר עם הרומן "זה הדברים".
בשנת 2012 נכלל ברשימה הקצרה של פרס ספיר עם ספרו "הילד האחרון של המאה".
בשנת 2015 נכלל ברשימה הקצרה של פרס ספיר עם ספרו "סיפור הווה על פני הארץ".
בשנת 2016 זכה בפרס קוגל לספרות יפה על ספרו "סיפור הווה על פני האֶרץ".
בשנת 2017 נכללה ברשימה הקצרה של פרס ספיר עם ספרו "כִּי גִי".
בשנת 2020 זכה בפרס ספיר ובפרס ברנר על ספרו "חמור".

מספריו:
ילדה שחורה. תל אביב, הוצאת בבל, תשנ"ט 1999; הספרייה הקטנה, 2013 (הספר בקטלוג ULI)
ככה אני מדברת עם הרוח, הספריה החדשה, 2002 (הספר בקטלוג ULI)
יתומים, הספריה החדשה, 2006 (הספר בקטלוג ULI)
זה הדברים, הספריה החדשה, 2010 (הספר בקטלוג ULI)
הילד האחרון של המאה, הספריה החדשה, 2011 (הספר בקטלוג ULI)
סיפור הווה על פני הארץ, הספריה החדשה, 2014 (הספר בקטלוג ULI)
כִּי גִי, הספריה החדשה, 2017
חמור, הספריה החדשה, 2019 (הספר בקטלוג ULI)
כולנו החמישה, הספריה החדשה, 2022[